حدد القانون أهداف الجهاز وفقاً للمادة التالية :

مادة (4) : يهدف الجهاز أساساً من خلال ممارسة الاختصاصات المخولة له بمقتضى هذا القانون إلى ما يلي:

• تحقيق رقابة فعالة على الأموال العامة والتأكد من حسن إدارتها من حيث الاقتصاد والكفاءة والفعالية.
• المساهمة في تطوير أداء الوحدات الخاضعة لرقابة الجهاز على الأخص في المجالات المالية والإدارية.
• المساهمة في تطوير ورفع مستوي أداء مهنة المحاسبة والمراجعة في الجمهورية اليمنية .